เรียกว่าเป็นอีกหนึ่งประเด็นที่สร้างความสับสนให้กับคนที่ตามข่าววัดพระบาทน้ำพุเป็นอย่างมาก เกี่ยวกับชื่อ อลงกต พลมุข ซึ่งปรากฏในทะเบียนราษฎร์ว่าเคยเป็นข้าราชการกรมชลประทาน จังหวัดพระนครศรีอยุธยา และเสียชีวิตไปเมื่อ 2 ปีก่อน โดยมีชื่อ-นามสกุล ตรงกับ พระอลงกต วัดพระพุทธบาทน้ำพุ และชื่อบิดาในข้อมูลทะเบียนราษฎร์คือ เสริมวิทย์ พลมุข เช่นเดียวกัน ก่อนที่ต่อมาทางกรมการปกครอง จะออกมาชี้แจงถึงเรื่องดังกล่าว โดยยืนยันบุคคลทั้งสองมิใช่บุคคลคนเดียวกัน เลขประจำตัวประชาชนไม่ซ้ำกัน
อย่างไรก็ตาม วานนี้ (23 ส.ค. 2568) หลวงพ่ออลงกต อดีตเจ้าอาวาสวัดพระบาทน้ำพุ กล่าวว่า มีกำลังใจที่ดีจากลูกศิษย์ลูกหาและคนที่ศรัทธา ซึ่งขณะนี้ได้ดำเนินการประสานกับคณะทำงานด้านกฎหมาย เพื่อรวบรวมข้อมูลเชิงหลักฐานเพื่อจะได้มีการตอบชี้แจงประเด็นต่างๆ ต่อสังคมให้รับรู้ คาดว่าในเร็วๆ นี้จะได้ชี้แจงให้ทราบต่อไป ส่วนประเด็นชื่อ หลวงพ่ออลงกต ซ้ำกับ นายอลงกต พลมุข ที่ อำเภอผักไห่ จ.พระนครศรีอยุธยา นั้น ขอปฏิเสธไม่ตอบคำถาม