เมื่อเวลา 19.30 น. วันที่ 3 ก.พ. 69 ตำรวจ สภ.เมืองปัตตานี ได้รับแจ้งพบวัตถุต้องสงสัยภายในห้องน้ำปั๊มน้ำมัน ปตท.บริเวณวงเวียนหอนาฬิกา อ.เมือง จ.ปัตตานี ทางเจ้าหน้าที่ตำรวจได้ประสานไปยังเจ้าหน้าที่ชุดเก็บกู้วัตถุระเบิดไปตรวจสอบ เมื่อไปถึงพบว่า ระเบิดได้ซุกซ่อนไว้ภายในที่พักน้ำของชักโครก ภายในห้องน้ำผู้พิการของปั๊ม

จากการตรวจสอบเบื้องต้น พบว่าเป็นระเบิดแสวงเครื่องบรรจุในขวดแสตนเลสขนาดเท่ากับขวดเครื่องดื่มชูกำลัง จุดฉนวนด้วยการตั้งเวลา บรรจุไว้ในถุงซิปล็อค ทางเจ้าหน้าที่ชุดเก็บกู้วัตถุระเบิด จึงได้เครื่องปืนยิงแรงดันน้ำเพื่อทำลายวงจรระเบิด ก่อนที่จะเข้าไปเก็บกู้ระเบิดไว้ได้

หลังจากนั้นทางเจ้าหน้าที่ได้รับแจ้งว่าพบพบวัตถุต้องสงสัยลักษะเดียวกันในห้องน้ำผู้พิการ ภายในปั๊มน้ำมัน ปตท.ถนนหนองจิก เยื่องโรงแรมซีเอส ปัตตานี ซึ่งเป็นจุดที่ 2 ทางเจ้าหน้าที่ชุดเก็บกู้วัตถุระเบิดจึงเข้าไปตรวจสอบ พบว่าระเบิดเป็นแบบเดียวกันกับจุดแรก และซุกไว้ภายในที่พักน้ำของชักโครก ทางเจ้าหน้าที่จึง ได้เข้าทำการเก็บกู้โดยใช้เครื่องปืนยิงแรงดันน้ำเช่นเดียวกัน และเก็บกู้ระเบิดได้สำเร็จ

จากการสอบสวนทราบว่า ในขณะที่มีประชาชนได้เข้าบริการห้องน้ำภายในปั๊มน้ำมัน เมื่อทำธุระเสร็จ ก็จะกดน้ำชักโครก แต่น้ำไม่ลงจึงตัดสินใจเปิดฝาชักโครกดูก็พบระเบิดซุกซ่อนอยู่จึงได้แจ้งเจ้าหน้าที่ของปั๊มก่อนจะแจ้งเจ้าหน้าที่ตำรวจเพื่อเข้าตรวจสอบ

ซึ่งหลังจากพบว่าเป็นระเบิดแล้ว เจ้าหน้าที่จึงได้แจ้งไปยังเจ้าของปั๊มต่าง ๆ เพื่อตรวจสอบสิ่งต้องสงสัยโดยเฉพาะห้องน้ำ ทำให้ทางพนักงานปั๊มทุกแห่งเร่งตรวจสอบ จึงพบว่ามีระเบิดซุกซ่อนอีกจุดหนึ่ง ทางเจ้าหน้าที่จึงสามารถเก็บกู้ไว้ได้ทัน โชคดีที่ทั้ง 2 จุดไม่มีผู้ใดได้รับบาดเจ็บ

หลังเกิดเหตุทางเจ้าหน้าที่ได้ตรวจสอบกล้องวงจรปิดตามจุดต่าง ๆ เพื่อเร่งติดตามตัวคนร้าย ส่วนระเบิดที่คนร้ายใช้ จากการตรวจสอบ พบว่า เป็นระเบิดแสวงเครื่องขนาดเล็ก ไม่มีสะเก็ดระเบิด จุดฉนวนด้วยการตั้งเวลา โดยเจ้าหน้าพบว่า เวลาที่คนร้ายก่อเหตุ ตั้งเวลาไว้ประมาณ 4 ทุ่ม ของวันที่ 14 ก.พ. ที่จะถึงนี้ ซึ่งตรงกับวันวาเลนไทม์

และยังพบว่า เวลาได้เดินมาแล้วเป็นเวลา 10 วัน และเหลือเวลาอีก 11 วัน ซึ่งหมายความว่า คนร้ายได้ลอบระเบิดมาวางไว้ล่วงหน้าเป็นเวลา 10 วันแล้ว ทางเจ้าหน้าทีจึงได้เร่งหาภาพวงจรปิดในห่วงวันดังกล่าวเพื่อติดตามตัวคนร้ายมาดำเนินคดีต่อไป ส่วนระเบิดที่คนร้ายใช้เป็นระเบิดขนาดเล็กจึงไม่มีสะเก็ดระเบิด เมื่อระเบิดขึ้นจะมีแต่เสียงดัง เชื่อว่าคนร้ายต้องการป่วนในห่วง 10 วันก่อนถือศีลอดในเดือนรอมฏอนที่จะถึงนี้